| Spiel 1 | 18.07.2008 |  |
BSC Young Boys | - |  |
FC Basel | 1:2 |
| Spiel 2 | 24.07.2008 |  |
FC Sion | - | |
BSC Young Boys | 2:1 |
| Spiel 3 | 27.07.2008 | |
BSC Young Boys | - |  |
FC Vaduz | 0:0 |
| Spiel 4 | 03.08.2008 |  |
FC Zürich | - | |
BSC Young Boys | 2:1 |
| Spiel 5 | 10.08.2008 | |
BSC Young Boys | - |  |
Neuchâtel Xamax | 2:1 |
| Spiel 6 | 17.08.2008 |  |
FC Luzern | - | |
BSC Young Boys | 0:3 |
| Spiel 7 | 24.08.2008 | |
BSC Young Boys | - |  |
FC Aarau | 3:3 |
| Spiel 8 | 31.08.2008 | |
BSC Young Boys | - |  |
Grasshopper Club | 1:3 |
| Spiel 9 | 14.09.2008 |  |
AC Bellinzona | - | |
BSC Young Boys | 1:2 |
| Spiel 10 | 27.09.2008 | |
FC Basel | - | |
BSC Young Boys | 1:2 |
| Spiel 11 | 05.10.2008 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Sion | 5:0 |
| Spiel 12 | 26.10.2008 | |
FC Vaduz | - | |
BSC Young Boys | 0:0 |
| Spiel 13 | 02.11.2008 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Zürich | 2:2 |
| Spiel 14 | 09.11.2008 | |
Neuchâtel Xamax | - | |
BSC Young Boys | 2:3 |
| Spiel 15 | 16.11.2008 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Luzern | 6:1 |
| Spiel 16 | 29.11.2008 | |
FC Aarau | - | |
BSC Young Boys | 1:1 |
| Spiel 17 | 07.12.2008 | |
Grasshopper Club | - | |
BSC Young Boys | 0:1 |
| Spiel 18 | 14.12.2008 | |
BSC Young Boys | - | |
AC Bellinzona | 3:0 |
| Spiel 19 | 07.02.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Basel | 3:2 |
| Spiel 20 | 15.02.2009 | |
FC Luzern | - | |
BSC Young Boys | 2:3 |
| Spiel 21 | 21.02.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Aarau | 4:0 |
| Spiel 22 | 28.02.2009 | |
FC Sion | - | |
BSC Young Boys | 2:3 |
| Spiel 23 | 08.03.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FAC Bellinzona | 3:0 |
| Spiel 24 | 15.03.2009 | |
FC Vaduz | - | |
BSC Young Boys | 3:1 |
| Spiel 25 | 22.03.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Zürich | 4:2 |
| Spiel 26 | 05.04.2009 | |
Neuchâtel Xamax | - | |
FC Zürich | 2:3 |
| Spiel 27 | 11.04.2009 | |
Grasshopper Club | - | |
BSC Young Boys | 3:3 |
| Spiel 28 | 19.04.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
Grasshopper Club | 3:1 |
| Spiel 29 | 23.04.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
Neuchâtel Xamax | 0:0 |
| Spiel 30 | 26.04.2009 | |
FC Zürich | - | |
BSC Young Boys | 3:0 |
| Spiel 31 | 05.05.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Vaduz | 6:0 |
| Spiel 32 | 10.05.2009 | |
AC Bellinzona | - | |
BSC Young Boys | 2:1 |
| Spiel 33 | 13.05.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Sion | 2:1 |
| Spiel 34 | 16.05.2009 | |
FC Aarau | - | |
BSC Young Boys | 0:1 |
| Spiel 35 | 24.05.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Luzern | 5:2 |
| Spiel 36 | 29.05.2009 | |
FC Basel | - | |
BSC Young Boys | 0:3 |
| Pl | Team | SP | S | U | N | Tore | Pts | |
| 1. | |
FC Zürich | 36 | 24 | 7 | 5 | 80:36 | 79 |
| 2. | |
BSC Young Boys | 36 | 22 | 7 | 7 | 85:46 | 73 |
| 3. | |
FC Basel | 36 | 22 | 6 | 8 | 72:44 | 72 |
| 4. | |
Grasshopper Club | 36 | 12 | 14 | 10 | 57:48 | 50 |
| 5. | |
FC Aarau | 36 | 11 | 11 | 14 | 35:51 | 44 |
| 6. | |
AC Bellinzona | 36 | 11 | 10 | 15 | 44:51 | 43 |
| 7. | |
Neuchâtel Xamax | 36 | 10 | 10 | 16 | 50:57 | 40 |
| 8. | |
FC Sion | 36 | 9 | 10 | 17 | 44:60 | 37 |
| 9. | |
FC Luzern | 36 | 9 | 8 | 19 | 45:62 | 35 |
| 10. | |
FC Vaduz | 36 | 5 | 7 | 24 | 28:85 | 22 |
| 1/32 Final | 21.09.2008 |  |
FC Ibach | - | |
BSC Young Boys | 0:6 |
| 1/16 Final | 29.10.2008 |  |
FC Alle | - | |
BSC Young Boys | 0:5 |
| 1/8 Final | 10.12.2008 |  |
FC Gossau | - | |
BSC Young Boys | 0:1 |
| 1/4 Final | 04.03.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
Grasshopper Club | 3:0 |
| 1/2 Final | 16.04.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Basel | 3:2 n.P. |
| Final | 20.05.2009 | |
BSC Young Boys | - | |
FC Sion | 2:3 |
| Q2 Spiel 1 | 14.08.2008 | |
BSC Young Boys | - |  |
Debreceni VSC | 4:1 |
| Q2 Spiel 2 | 28.08.2008 | |
Debreceni VSC | - | |
BSC Young Boys | 2:3 |
| R1 Spiel 1 | 18.09.2008 | |
BSC Young Boys | - |  |
Club Brugge KV | 2:2 |
| R1 Spiel 2 | 02.10.2008 | |
Club Brugge KV | - | |
BSC Young Boys | 2:0 |
| Nr. | Pos. | Name | Vorname | Sp | min | GT | GT/Sp | gelb | gelb-rot | rot |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |